相传妙义寺是室町时代的益田氏第13代当主兼家所创建的曹洞宗寺院，作为益田的重要宗教核心之一而广受信仰。天正9年（1581年）由第19代当主藤兼、第20代当主元祥父子重建，并将其定位为此地区的曹洞宗核心寺院。
其境内的樱谷还保留着宏伟壮观的五轮塔，相传该塔是藤兼与兼家之墓。此外，也可从传至寺庙的佛像与古文献中亲身感受历史。
主殿举办坐禅体验与演奏会等，可在此体味多种多样的文化，还可在寺庙境内和庭园欣赏四季不同的各种花卉。穿过妙义寺前的石桥向北延伸的参拜道是中世纪城下的主轴线。
